El departamento insular se caracteriza por contar con una amplia flora y fauna, sin contar con un extenso territorio en el Caribe para que puedan reproducirse especies asombrosas.
Es por ello que enumeraremos las 12 especies endémicas registradas de Islas de la Bahía, desde aves hasta reptiles y en su mayoría en peligro de extinción, por lo que la población deberá apreciar con respeto cada una de ellas.
La lista de las 12 especies la compone:
- Cangrejo de agua dulce de Roatán
- Isla de Roatán Agouti
- Iguana de cola espinosa de Roatán
- Bandera de Roatán
- Pata temblorosa de Roatán
- Roatán woodslave
- Serpiente de coral de Roatán
- Serpiente de cola larga de Roatán
- Serpiente de vid amarilla
- Lechuza (Tyto Alba)
- Loro Nuca Amarilla
- Escorpión Insular